В 1985 году окончил Ленинградскую Лесотехническую Академию, лесохозяйственный факультет. В 1990—1991 годах - учебная программа Ассоциации Национального Центра, США, специалист в области переговоров и посредничества.
Юрий Перелыгин имеет многолетний опыт практической работы и консультирования в области планирования городов и территорий, разработке региональных стратегий, занимается проблемами градостроительного права, инвестиционного проектирования, новых строительных технологий, управлением проектами. В настоящее время занимает должность генерального директора ООО «Институт «Ленгипрогор»; 2008—2010 — заместитель генерального директора по строительству ООО «Конгресс-центр Константиновский»; 2007—2008 — заместитель начальника департамента по капитальному строительству ОАО «Газпром нефть»; 2004—2007 — директор Департамента регионального социально-экономического развития и территориального планирования в Министерстве регионального развития РФ; Март 2002—октябрь 2004 — научный руководитель Фонда «Центр стратегических разработок «Северо-Запад». В сфере его ответственности — определение общей идеологии исследований Фонда и координация работы проектных групп; 2004 −2009 — член Попечительского совета Фонда «Центр стратегических разработок «Северо-Запад»; с 2009 по настоящее время — Член Правления Фонда «Центр стратегических разработок «Северо-Запад». С 1989 года—генеральный директор ООО «Ленгипрогор», главный инженер строительной компании «Град Петра». 1985—1989 — сотрудник, затем главный инженер института РосНИПИ Урбанистики.